בעקבות ההתקפות האלה ובהמשך למבצע חרבות ברזל, נתפסו בשטחה של מדינת ישראל וגם ברצועת עזה מחבלים רבים, ולגביהם מתקיימים הליכי חקירה בחשד לעבירות ביטחון. לעצורים האלה נוספו כאמור לא מעט מחבלים נוספים, שנתפסו במהלך התמרון הקרקעי ברצועת עזה. פרקי הזמן הן להארכות המעצר והן למניעת פגישה עם עורך דין בחוק המעצרים לא מותאמים לצרכים, למורכבות ולאתגרים החריגים שנוצרו בעקבות המעצרים הללו.